上海河口海洋测绘工程技术研究中心于2018年11月由上海市科委批准成立。中心依托上海海洋大学，并联合中科院上海技术物理研究所、长江口水文水资源勘测局、上海市海洋监测预报中心、上海市海洋管理事务中心共同建设。工程中心以服务国家海洋强国战略、结合上海建设全球创新中心需求，重点聚焦河口海洋测绘方向，构建“产学研用”一体化发展模式。工程中心开展了河口和近海测绘核心技术装备的研制，以及河口、近海和深远海测绘关键技术研究，形成了集卫星、航空、无人机、地面和水下的空天地水一体化的河口海洋空间观测能力。中心将进一步开展海洋测绘装备研发和技术服务，提升海洋全要素测绘技术能力，培养一流的海洋测绘科学研究和工程技术人才。